Como un paso muy importante que ratifica la calidad del programa Magíster en Gestión de Empresas ha sido el pronunciamiento de la Agencia de Acreditación del Colegio de Ingenieros de Chile, que en su primer proceso de acreditación fue certificado por tres años, de 2017 a 2020, obteniendo el máximo de años que un programa de reciente creación puede obtener.
El MGE fue reconocido como un programa de alto nivel y que va en la senda de la excelencia, destacando su claustro académico con productividad científica, vinculación con el medio empresarial y público, disponiendo de un adecuado soporte en infraestructura y equipamiento. Es así como la agencia Acredita CI, destacó la articulación del magíster con el pregrado, el trabajo conjunto de profesores de ambas sedes, la motivación de los estudiantes y un alto porcentaje de académicos jornada completa con grado de Doctor que imparten asignaturas en el Magíster.